Anëtar : Hyrje |Regjistrim |Ngarko njohuri
Kërko
Sistem i thjeshtuar i futjes së linjës molekulare
1.histori
2.terminologji
3.Përkufizimi i bazuar në grafik
4.Përshkrim
4.1.atomet
4.2.obligacionet
4.3.Rings [Modifikim ]
Strukturat unazore janë shkruar duke thyer çdo unazë në një pikë arbitrare (edhe pse disa zgjedhje do të çojnë në një SMILES më të lexueshëm se të tjerat) për të bërë një strukturë aciklike dhe për të shtuar etiketat e mbylljes unazore numerike për të treguar lidhjen mes atomeve jo-ngjitur.
Për shembull, ciklohekani dhe dioksani mund të shkruhen respektivisht si C1CCCCC1 dhe O1CCOCC1. Për një unazë të dytë, etiketa do të jetë 2. Për shembull, decalin (decahydronaphthalene) mund të shkruhet si C1CCCC2C1CCCC2.
SMILES nuk kërkon që numrat e unazave të përdoren në ndonjë mënyrë të veçantë dhe lejon numrin e unazës zero, edhe pse kjo përdoret rrallë. Gjithashtu, lejohet të ri-përdorim numrat e unazave pas mbylljes së unazës së parë, edhe pse kjo zakonisht i bën formatet më të vështira për t'u lexuar. Për shembull, bicikloheksil zakonisht shkruhet si C1CCCCC1C2CCCCC2, por mund të shkruhet edhe si C0CCCCC0C0CCCCC0.
Shifrat e shumëfishta pas një atomi të vetëm tregojnë lidhje të shumta të mbylljes së unazës. Për shembull, një notë alternative SMILES për dekalin është C1CCCC2CCCCC12, ku karboni i fundit merr pjesë në të dyja lidhjet mbyllëse 1 dhe 2. Nëse nevojiten dy numra shifrorë, etiketa paraprihet nga%, kështu që "C?" është një lidhje e vetme unazore-mbyllëse, e unazës 12.
Numrat e mbylljes së unazës mund të paraprihen nga një lloj lidhjeje. Për shembull, ciklopropeni zakonisht shkruhet C1 = CC1, por nëse lidhja e dyfishtë zgjidhet si lidhja e mbylljes së unazës, mund të shkruhet si C = 1CC1, C1CC = 1 ose C = 1CC = 1. (Formulari i parë është i preferuar.) C = 1CC-1 është e paligjshme, pasi përcakton në mënyrë eksplicite lloje konfliktuale për lidhjen e mbylljes së unazës.
Lidhjet e mbylljes së unazave nuk mund të përdoren për të treguar lidhjet e shumëfishta. Për shembull, C1C1 nuk është një alternativë e vlefshme për C = C për etilen. Megjithatë, ato mund të përdoren me jo-obligacione; C1.C2.C12 është një mënyrë alternative, por ligjore alternative për të shkruar propan, më shpesh CCC me shkrim.
Zgjedhja e një pike unazore ngjitur me grupet e bashkangjitura mund të çojë në një formë më të thjeshtë të SMILES duke shmangur degët. Për shembull, cyclohexane-1,2-diol është shkruar thjesht si OC1CCCCC1O; zgjedhja e një vendndodhjeje tjetër të rrotullimit prodhon një strukturë të degëzuar që kërkon kllapa për të shkruar.
4.4.aromaticity
4.5.bronkial
4.6.stereokimi
4.7.Izotopet
4.8.shembuj
4.9.Shembuj të tjerë të SMILES
5.Zgjerime
6.konvertimit
[Ngarkoni Më shumë Përmbajtje ]


Copyright @2018 Lxjkh